平臺(tái)負(fù)責(zé)人:陳瑜潔 博士? ? ? ? 平臺(tái)技術(shù)管理助理:程年皓? 韓爽? ? ? ? 聯(lián)系方式:qbio@picb.ac.cn
發(fā)展歷史
“Uli Schwarz量化生物學(xué)質(zhì)量控制平臺(tái)”的前身為“馬普客座實(shí)驗(yàn)室”,該客座實(shí)驗(yàn)室由Uli Schwarz教授于1985年創(chuàng)立。Uli Schwarz教授為中德的科研合作作出了巨大貢獻(xiàn),并且還協(xié)助創(chuàng)立了中國(guó)科學(xué)院-馬普學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)伙伴研究所(以下簡(jiǎn)稱計(jì)算生物學(xué)所)。為了紀(jì)念Uli Schwarz教授,計(jì)算生物學(xué)所在整合和完善該客座實(shí)驗(yàn)室后,于2008年10月正式將其改名為“Uli Schwarz公共實(shí)驗(yàn)平臺(tái)”,作為一個(gè)分子和細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的濕性服務(wù)平臺(tái)服務(wù)于整個(gè)計(jì)算生物學(xué)所。隨著生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心的建立,Uli Schwarz公共實(shí)驗(yàn)平臺(tái)更名為“Uli Schwarz量化生物學(xué)質(zhì)量控制平臺(tái)”并加入生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心。重點(diǎn)為營(yíng)養(yǎng)與健康所以及其他兄弟研究單位提供數(shù)據(jù)建模所需要的各類基因、表型、表達(dá)、代謝、模式動(dòng)物衰老、人臉圖像、組織三維重構(gòu)立體圖像等高通量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),并為“干性”數(shù)據(jù)建模提供高通量的濕性驗(yàn)證條件。
平臺(tái)概況
“Uli Schwarz量化生物學(xué)質(zhì)量控制平臺(tái)” 占地250平米左右,為計(jì)算生物學(xué)所提供基本的實(shí)驗(yàn)技術(shù)支持、實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地和技術(shù)培訓(xùn)等。該平臺(tái)由DNA實(shí)驗(yàn)室、 RNA實(shí)驗(yàn)室、有毒試劑實(shí)驗(yàn)室、實(shí)驗(yàn)解剖室、樣品存儲(chǔ)區(qū)、公共細(xì)胞房、高通量分子量化分析集成系統(tǒng)子平臺(tái)(圖1A)以及高通量圖像采集分析集成系統(tǒng)子平臺(tái)(圖1B)組成。該平臺(tái)不僅配備了基礎(chǔ)的細(xì)胞分子生物學(xué)常用儀器,而且還配備了先進(jìn)的諸如激光光片顯微成像系統(tǒng)、雙光子激光共聚焦正置顯微鏡等大型儀器。不僅面向中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康所及其他兄弟單位開放,還面向上海市及國(guó)內(nèi)其它科研單位以及企業(yè)開放。

技術(shù)優(yōu)勢(shì)
本平臺(tái)技術(shù)人員熟練掌握平臺(tái)現(xiàn)有儀器設(shè)備,并善于探索適合特殊實(shí)驗(yàn)的條件和方法,能對(duì)各類實(shí)驗(yàn)提供很好的實(shí)驗(yàn)幫助。并且該平臺(tái)已成熟掌握CUBIC組織透明化的方法(圖2)以及快速成像和三維重構(gòu)的方法(圖3),能夠在透明化全腦以及透明化大樣本(如:胚胎,肌肉,心臟等)的制樣和成像方面提供強(qiáng)有力的服務(wù)與支持。同時(shí),本平臺(tái)技術(shù)人員在長(zhǎng)時(shí)程多樣本的活體成像方面以及雙光子二次諧波成像方面都能做到很好的技術(shù)支撐。
