10月29日下午,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所所級科學(xué)數(shù)據(jù)中心舉辦了“多組學(xué)數(shù)據(jù)管理與共享”培訓(xùn),旨在幫助科研人員更加深入地了解多組學(xué)數(shù)據(jù)的發(fā)布流程、質(zhì)控以及提交與共享方法。本次培訓(xùn)由中心資深工程師許敏捷擔(dān)任主講人。
培訓(xùn)中,許敏捷詳細(xì)介紹了多組學(xué)數(shù)據(jù)匯交共享平臺NODE的功能和服務(wù)。該平臺不僅支持多種類型的組學(xué)數(shù)據(jù),如基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)等,還支持不同格式的數(shù)據(jù)文件上傳,如fastq、bam、fasta等。此外,平臺還提供了方便快捷的數(shù)據(jù)提交方式,線上與線下數(shù)據(jù)上傳均得到優(yōu)化,確保用戶能夠順利地完成數(shù)據(jù)上傳、歸檔和發(fā)布。許敏捷還強調(diào)了元數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制對于數(shù)據(jù)共享的重要性,并演示了如何上傳元數(shù)據(jù)和完成數(shù)據(jù)歸檔。此外,她還介紹了NODE平臺的數(shù)據(jù)管理與發(fā)布流程,包括如何將數(shù)據(jù)設(shè)置為私有、受限或公開狀態(tài),以及如何在不同狀態(tài)間轉(zhuǎn)換,從而實現(xiàn)安全的數(shù)據(jù)共享。學(xué)員們積極參與,踴躍發(fā)言,并與許敏捷就日常數(shù)據(jù)提交過程中遇到的具體問題進(jìn)行了深入交流和討論。此次培訓(xùn)使與會人員對所級科學(xué)數(shù)據(jù)中心提供的數(shù)據(jù)管理與匯交服務(wù)有了更深入的了解,并為科學(xué)研究提供了有力支持。
多維組學(xué)數(shù)據(jù)百科全書(NODE)是所級科學(xué)數(shù)據(jù)中心開發(fā)的一個多組學(xué)數(shù)據(jù)資源平臺,它具備“分層分級、安全共享”的數(shù)據(jù)管理與共享機制。該平臺能夠滿足基因組、轉(zhuǎn)錄組、微生物組的基本匯交需求,支撐科研項目和醫(yī)療機構(gòu)的數(shù)據(jù)匯交需求,同時滿足重大疾病和自然人群的生命組學(xué)數(shù)據(jù)庫建設(shè)需求。其主要功能包括組學(xué)數(shù)據(jù)的上傳、下載、發(fā)布、審閱、分享、管理、質(zhì)量評估、申請等。更多信息請訪問NODE平臺:https://www.biosino.org/node
營養(yǎng)與健康所所級科學(xué)數(shù)據(jù)中心將持續(xù)舉辦相關(guān)主題的培訓(xùn)活動,以幫助更多科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類服務(wù)。同時,所級科學(xué)數(shù)據(jù)中心還設(shè)計了相關(guān)調(diào)研問卷(詳見文末二維碼),誠邀科研人員提出寶貴的意見和建議,以便進(jìn)一步優(yōu)化和提升服務(wù)質(zhì)量。通過與科研人員的積極互動和反饋,中心將不斷改進(jìn)服務(wù)流程,提升技術(shù)支持質(zhì)量,為進(jìn)一步滿足科研需求提供更加優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。

許敏捷作培訓(xùn)報告

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