7月24日下午，中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心舉辦了“單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)高級(jí)分析進(jìn)階”培訓(xùn)，旨在幫助科研人員了解和掌握相關(guān)技術(shù)和工具，以提升自身生物信息分析能力。本次培訓(xùn)由中心資深工程師黃俞瑋擔(dān)任主講人，其研究方向?yàn)樯镄畔W(xué)大數(shù)據(jù)分析和流程搭建，目前主要負(fù)責(zé)單細(xì)胞及空間轉(zhuǎn)錄組方向的分析工作。
黃俞瑋首先向?qū)W員們介紹了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用方向及示例，包括細(xì)胞類(lèi)型及功能、細(xì)胞群的數(shù)量及比例特征、細(xì)胞群的特征基因及功能、細(xì)胞群間的發(fā)育順序、細(xì)胞群間的相互作用。隨后，她詳細(xì)介紹了ViPMAP（https://www.biosino.org/vipmap/home）單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)高級(jí)分析實(shí)操，包括高級(jí)分析參數(shù)解析及任務(wù)提交管理、分析結(jié)果解讀。
培訓(xùn)過(guò)程中，學(xué)員們積極參與，踴躍發(fā)言，并與主講人在關(guān)鍵技術(shù)和方法上進(jìn)行了深入交流和討論，比如是否可以進(jìn)行Cell Chat分析、如何比較Case和Control組數(shù)據(jù)，以及如何整合和去除批次效應(yīng)等。通過(guò)此次培訓(xùn)，學(xué)員們不僅對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用有了更深入的了解，還掌握了ViPMAP單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)高級(jí)分析的實(shí)際操作，包括高級(jí)分析流程的操作及分析報(bào)告的生成與解讀等。這將進(jìn)一步提升學(xué)員們對(duì)所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心提供的常規(guī)生物信息分析服務(wù)的了解，為科學(xué)研究工作提供有力支持。
營(yíng)養(yǎng)與健康所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心將持續(xù)舉辦相關(guān)主題的培訓(xùn)活動(dòng)，以幫助更多的科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類(lèi)服務(wù)。同時(shí)，所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心還設(shè)計(jì)了相關(guān)的調(diào)研問(wèn)卷（詳見(jiàn)文末二維碼），誠(chéng)邀科研人員提出寶貴的意見(jiàn)和建議，以便進(jìn)一步優(yōu)化和提升服務(wù)質(zhì)量。通過(guò)與科研人員的積極互動(dòng)和反饋，中心將不斷改進(jìn)服務(wù)流程，提升技術(shù)支持質(zhì)量，為進(jìn)一步滿足科研需求提供更加優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。
黃俞瑋資深工程師作培訓(xùn)報(bào)告
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