1月9日下午,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心舉辦了“生物醫(yī)學(xué)知識(shí)圖譜構(gòu)建技術(shù)”培訓(xùn),旨在幫助科研人員了解和掌握生物醫(yī)學(xué)知識(shí)圖譜構(gòu)建技術(shù)。本次培訓(xùn)由中心高級(jí)工程師凌鋆超擔(dān)任主講人,凌鋆超的研究方向是生命組學(xué)數(shù)據(jù)庫/知識(shí)庫建設(shè)與生物信息學(xué)分析,他目前主要負(fù)責(zé)健康醫(yī)療和生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫研發(fā)方向的架構(gòu)設(shè)計(jì)與研發(fā),研發(fā)了包括中國人群動(dòng)態(tài)基因組數(shù)據(jù)庫、NODE國家組學(xué)數(shù)據(jù)百科全書、PGG.SV結(jié)構(gòu)變異數(shù)據(jù)庫在內(nèi)的多項(xiàng)生命科學(xué)數(shù)據(jù)庫資源。此外,他還作為項(xiàng)目骨干參與了多項(xiàng)國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目,并積累了豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。曾在Nucleic Acids Research、Science Bulletin、Bioinformatics等期刊發(fā)表多篇基因組學(xué)和數(shù)據(jù)庫相關(guān)文章。
凌鋆超首先介紹了數(shù)據(jù)庫、知識(shí)庫和知識(shí)圖譜的概念及區(qū)別,并對(duì)知識(shí)圖譜進(jìn)行了基本的介紹。隨后,他介紹了常見的知識(shí)圖譜以及知識(shí)圖譜的典型應(yīng)用、構(gòu)建的關(guān)鍵技術(shù)、構(gòu)建知識(shí)圖譜的必要性和常見問題。此外,他還詳細(xì)介紹了中心已經(jīng)構(gòu)建的基于條件的精準(zhǔn)藥物知識(shí)庫、結(jié)核分枝桿菌免疫原知識(shí)圖譜等。最后,凌鋆超通過數(shù)據(jù)、大模型和下游任務(wù)三個(gè)方面對(duì)知識(shí)圖譜進(jìn)行了總結(jié)和未來發(fā)展展望。
在培訓(xùn)過程中,學(xué)員們積極參與,踴躍發(fā)言,并與凌鋆超就知識(shí)圖譜下游預(yù)測、如何界定知識(shí)的可靠性以及如何解讀知識(shí)圖譜等問題進(jìn)行了深入交流和討論。這次培訓(xùn)使學(xué)員們更深入地了解了所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心基于大模型和知識(shí)模式驅(qū)動(dòng)的條件知識(shí)圖譜方面的工作,并了解到中心可以提供的數(shù)據(jù)庫和工具軟件開發(fā)服務(wù),為科學(xué)研究提供了有力支持。
營養(yǎng)與健康所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心將繼續(xù)舉辦相關(guān)主題的培訓(xùn)活動(dòng),以幫助更多的科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類服務(wù)。同時(shí),所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心也歡迎科研人員提出寶貴意見和建議,以進(jìn)一步完善和提升服務(wù)質(zhì)量。通過與科研人員的積極互動(dòng)和反饋,中心將不斷改進(jìn)服務(wù)流程和技術(shù)支持,以滿足科研人員的需求,為科研人員提供更加優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。

凌鋆超高級(jí)工程師作培訓(xùn)報(bào)告